Sekwencjonowanie genomu pomocne w monitorowaniu oporności na antybiotyki

Zastosowanie sekwencjonowania całego genomu może poprawić sposób monitorowania oporności na antybiotyki u zwierząt. Metoda ta jednocześnie generuje dużą ilość danych, które można wykorzystać do innych badań epidemiologicznych i analiz.

 

Przepisy ograniczające zużycie antybiotyków w hodowli zwierząt mają wejść w życie w 2021 r. Metoda sekwencjonowania całego genomu, zdaniem Europejskiego Urzędu ds. Bezpieczeństwa Żywności (EFSA), z powodzeniem mogłoby być stopniowo wprowadzane do działań monitorujących państwa członkowskie.

 

Korzystając z tego sposobu można zidentyfikować w bakteriach oporne na antybiotyki geny. Metoda fenotypowania testuje bakterie pod kątem oporności na określone antybiotyki. 

 

Ma to nie tylko potencjał do skuteczniejszego przewidywania oporności, ale także generuje dużą ilość danych, które można wykorzystać do innych badań epidemiologicznych i analiz, podaje portal 3trzy3.pl na podstawie www.efsa.europa.eu.

 

Eksperci podkreślają znaczenie poznania mechanizmu powstawania oporności na antybiotyki oraz jego rozprzestrzeniania się w środowisku, w którym żywność jest produkowana lub przetwarzana. Ich zdaniem obszar ten wymaga bliższego poznania. 

 

Raport przedstawiony przez EFSA zawiera także zalecenia dotyczące wielkości próbek oraz sugeruje monitorowanie oporności na antybiotyki, ponieważ jest to istotne dla zdrowia publicznego. 

 

Działania te pozwalają na lepsze wykrywanie nowych mechanizmów oporności. Monitorowanie jest również jednym z priorytetów planu działania UE dotyczącego badania powstawania oporności na środki przeciwdrobnoustrojowe.

 

EFSA dokonał także przeglądu sposobów, w jaki obecnie monitoruje się oporność na antybiotyki w UE, uwzględniając najnowsze osiągnięcia naukowe i technologiczne.